中小企業向け会計ソフトおすすめ5選！種類別の特徴や機能、選び方の注意点を網羅

おすすめの中小企業向けの会計ソフトを紹介します。比較ポイントや種類方なども解説しているので、当記事を見れば自社に合った会計ソフトを紹介可能です。

中小企業向けの会計ソフトの導入を検討している方はぜひご覧ください。

中小企業向け会計ソフトとは？

中小企業向け会計ソフトは、限られた人員で煩雑な経理業務を効率化するために設計されたITツールです。高度な内部統制やグループ連結決算を重視する大企業向けソフトとは異なり、専門知識がなくても直感的に操作できる点に大きな特徴があります。

特に最新のクラウド型は、法改正への自動アップデートや外部連携に優れており、運用の負担を抑えつつ、戦略的な経営判断を下すための基盤となります。

導入すべき理由

経理業務の劇的な効率化とミス削減

銀行口座やクレジットカードの取引データを自動で取得・連携できるため、手入力による転記作業や計算ミスを大幅に削減できます。

仕訳作業が簡略化されることで、専門的な簿記知識が乏しくても、正確かつ迅速な会計処理が可能になります。

リアルタイムな経営状況の可視化

蓄積されたデータはリアルタイムで集計されるため、経営者は常に最新の財務状況を把握し、迅速な意思決定を行えます。

法改正への対応も自動更新で行われるため、バックオフィス全体の生産性を高め、健全な経営を支える強力な武器となります。

小規模法人・零細企業向けのソフトの特徴

小規模法人や零細企業向けの会計ソフトは、専任の経理担当者がいない環境を想定し、「簿記の知識がなくても直感的に使える操作性」に特化しているのが最大の特徴です。

最大の特徴は、銀行口座やクレジットカードとの連携による自動仕訳機能です。日々の取引データが自動で取得され、AIが勘定科目を推論してくれるため、手入力による転記作業やミスを劇的に減らし、業務を効率化できます。

また、コスト面でも導入しやすいプランが多く、クラウド型であればサーバー管理や法改正への手動対応も不要です。

スマホアプリで領収書を撮影するだけで経費精算が完結するなど、経営者が本業の隙間時間に経理業務を無理なくこなせる設計となっており、限られたリソースでの正確な会計管理を強力に支援します。

中小企業向け会計ソフトの種類

中小企業向けの会計ソフトはクラウド型とインストール型の2種類があります。それぞれの特徴、違いを比較していきます。

	クラウド型	インストール型
主な特徴	ネット経由で利用 場所を選ばず、自動連携が強力	PCにソフトを導入 動作が軽く、月額コストが低い
場所・デバイス	PC・スマホ・タブレットどこからでも可能	インストールした特定のPCのみ
自動化機能	銀行・クレカ等の取引データを自動取得	基本は手入力 一部、データ連携対応製品あり
法改正対応	自動でアップデート 常に追加費用なしで最新	手動での更新作業や新バージョンの買い直しが必要
初期費用	0円〜低価格	数万円（買い切りソフト代）
運用コスト	月額・年額のサブスクリプション制	基本無料（保守サポート加入時は別途費用）
データ管理	クラウド上に自動保存 バックアップ不要	PC内に保存 各自でバックアップが必要
おすすめの企業	経理を効率化したい企業 テレワークを導入したい企業	入力作業が大量にある企業 月額固定費を抑えたい企業

クラウド型

クラウド型会計ソフトは、インターネットを通じてブラウザ上で利用する仕組みで、場所を選ばず経理業務を行えるのが最大の特徴です。

中小企業が導入することで、銀行口座やクレジットカードの取引データを自動で取得・連携できるようになり、手入力による転記作業の大幅な削減と効率化が実現します。

データはクラウド上に集約されるため、複数の拠点やテレワーク環境でも最新の会計情報を共有でき、経営者はリアルタイムに経営状況を把握できます。

また、法改正や消費税増税への対応もシステム側で自動的にアップデートされるため、常に最新の状態で運用可能です。サーバー管理やデータのバックアップ作業も不要となり、低コストで安全に高度な会計管理を維持できます。

インストール型

インストール型（デスクトップ型）の会計ソフトは、パソコンに直接ソフトを導入して使用する形態で、古くから多くの中小企業に親しまれています。

クラウド型とは異なり、インターネット環境に左右されず高速かつ軽快に動作するため、大量の仕訳入力を行う経理担当者の作業効率化に大きく貢献します。

一度購入すれば月額費用を抑えて運用できる点や、自社のPC内にデータを保管するため、社外への情報流出を防ぎたい経営判断にも適しています。

銀行取引の自動連携機能を持つ製品も増えており、記帳作業の自動化も可能です。ただし、法改正への対応には更新作業が必要な場合があるため、常に最新の状態を維持することが正確な会計管理の鍵となります。

中小企業向け会計ソフトの機能

会計ソフトの主な機能を、中小企業の担当者が押さえておくべきポイントに絞って表にまとめました。

	内容	メリット
仕訳・記帳自動化	銀行・クレカ連携、AIによる勘定科目推論	入力作業の削減と転記ミスの防止
帳簿・決算書作成	総勘定元帳、試算表、貸借対照表、損益計算書	専門知識がなくても正確な書類作成
経営分析	売上推移、キャッシュフロー、部門別管理	リアルタイムな経営状況の可視化
外部連携	請求書発行、給与計算、車両管理アプリ連携	バックオフィス業務の一元管理
法改正対応	インボイス制度、電子帳簿保存法への準拠	コンプライアンス遵守の自動化

会計ソフトの価値は、単なる「帳簿作成」から「経営の意思決定支援」へと進化しています。特にクラウド型を導入すれば、銀行取引などのデータが自動で連携されるため、手入力作業を最小限に抑えつつ、常に最新の財務状況を把握できます。

また、車両管理や請求書システムと連携させることで、社内のデータが一つに繋がり、二重入力の手間もなくなります。自社の規模や必要な管理レベルに合わせ、これらの機能を過不足なく備えたソフトを選ぶことが、業務効率化の鍵となります。

中小企業向け会計ソフトの選び方

中小企業向けの会計ソフトの選び方を紹介します。

使いやすいソフトか

中小企業が会計ソフトを選ぶ際、最も重視すべきは「現場の担当者が迷わず使えるか」という直感的な操作性です。どんなに多機能なソフトを導入しても、操作が複雑では経理業務の効率化は望めません。

特に最新のクラウド型は、専門的な会計知識がなくても、銀行やクレジットカードの取引データを自動で取り込み、AIが適切な勘定科目を推論してくれます。

この自動連携機能により、手作業による転記や入力ミスが大幅に削減され、日々の作業負担が劇的に軽減されます。

また、経営状況を可視化するレポート画面が分かりやすいか、スマートフォンのアプリから隙間時間にデータ確認や承認作業ができるかも重要な判断材料です。

導入前に無料トライアルを活用し、実際の取引入力の流れが自社の業務にフィットするかを確認することが、失敗しないソフト選びの鍵となります。

自動仕訳・API連携の対応範囲

中小企業の経理業務を劇的に効率化させる鍵は、会計ソフトが備える「自動仕訳」と「API連携」の対応範囲にあります。

クラウド型ソフトを導入すれば、銀行口座やクレジットカード、POSレジなどの外部システムから取引データを直接取得できるようになります。このAPI連携により、明細が自動で会計ソフトへ反映されるため、手入力による転記作業や計算ミスを未然に防ぎ、正確なデータ管理が実現します。

特に注目すべきは自動仕訳機能で、取得したデータに対してAIが適切な勘定科目を推論し、自動で起票を行います。これにより、仕訳作業に要する時間を大幅に短縮でき、経営者はリアルタイムに最新の経営状況を把握することが可能です。

選定の際は、自社が利用する金融機関や決済サービスが連携対象に含まれているか、また法改正への対応が迅速かを必ず確認しましょう。

対応範囲が広いソフトほど、導入後の作業負担を最小限に抑え、付加価値の高い経理実務へとシフトできます。

料金体型とコストパフォーマンス

中小企業の会計ソフト選びでは、表面的な月額料金だけでなく、導入による経理業務の効率化を含めたトータルなコストパフォーマンスを見極める必要があります。

特にクラウド型ソフトは、初期費用を抑えて導入できる一方で、利用人数や連携するデータの件数によって月額費用が変動する料金体系が一般的です。

価格を抑えるために機能を制限しすぎると、銀行取引の自動取得や他システムとの連携ができず、結局は手作業による仕訳や転記作業が残り、人件費という見えないコストが増大しかねません。

また、インボイス制度などの法改正への対応も、自動アップデートにより追加費用なしで受けられるかを確認しておくべきです。

サポート体制・操作支援の充実度

初めてクラウド型ソフトを導入する場合、銀行口座との連携設定や取引データの自動仕訳ルールの構築など、初期段階で戸惑う作業が少なくありません。

経理業務の効率化を確実に実現するためには、電話やチャット、メールなど自社の担当者が相談しやすい窓口が備わっているかを確認すべきです。

特に、法改正への対応や決算期の複雑な会計処理が必要な際、迅速な回答が得られる体制があれば、経営判断を止めるリスクを回避できます。

操作画面上のナビゲーション機能や充実したヘルプページも重要で、これらが整っていれば属人化しがちな経理実務を標準化でき、担当者の変更時もスムーズな引き継ぎが可能です。

中小企業向け会計ソフトのおすすめ5選

中小企業向けの会計ソフトのおすすめ5つを比較していきます。

	料金	特徴
freee会計	月額　1,780円〜 年額　11,760円～	簿記の知識がなくても使いやすい 自動仕訳の精度が高い
マネーフォワード クラウド会計	月額　3,980円～ 年額　35,760円～	2,400以上の金融関連サービスとの連携 同シリーズとの連携による拡張性
弥生会計 Next	月額　2,900円～ 年額　34,800円～	多くの税理士が推奨するソフト 業界最大規模のカスタマーセンター インストール型もある
PCAクラウド会計	月額13,860円〜	強固な部門・階層管理 同シリーズとの連携による拡張性
勘定奉行クラウド	・小規模企業向け iEシステム：年額93,000円 iJシステム：年額141,000円、初期設定50,000円 ・中小企業向け iAシステム：年額234,000円、初期設定50,000円 iBシステム：年額282,000円、初期設定60,000円 iSシステム：年額336,000円、初期設定70,000円	自動仕訳が高精度 セキュリティ機能が強力

freee会計

料金プラン	月額　1,780円〜 年額　11,760円～
トライアル期間	30日間
導入実績	・ラクスル株式会社 ・株式会社山本商店 ・三井住友海上エイジェンシー・サービス株式会社
製品タイプ	クラウド型
公式サイト	https://www.freee.co.jp/

freee会計は、従来の会計ソフトの常識を覆す統合型の仕組みが最大の特徴です。最大の特徴は、簿記の知識がなくても家計簿感覚で操作できる直感的なUIにあります。

導入により、銀行口座やクレジットカードとの連携、さらにはスマホでの領収書撮影を通じて取引データが自動で取得・仕訳され、転記作業をほぼゼロにできます。

他社にない強みは、経理業務だけでなく、請求書発行や経費精算、さらには人事労務まで一つのデータ基盤で完結できる点です。これにより、二重入力の手間を省きながら、経営状況をリアルタイムに可視化することが可能になります。

法改正への自動対応や高い拡張性も備えており、業務効率化と攻めの経営を両立したい中小企業にとって、非常に心強い選択肢となります。

マネーフォワード クラウド会計

料金プラン	月額　3,980円～ 年額　35,760円～
トライアル期間	30日間
導入実績	・日本精器株式会社 ・マックス株式会社 ・大学教員、ハンドメイド作家など
製品タイプ	クラウド型
公式サイト	https://biz.moneyforward.com/

マネーフォワード クラウド会計は、他社を圧倒する2,400以上の金融関連サービスとの連携実績を誇り、多種多様な取引を抱える中小企業の経理業務を劇的に効率化します。

導入により、銀行口座やクレジットカードの入出金データが自動で取得され、AIが過去の傾向から勘定科目を推論して自動仕訳を行うため、手入力による転記作業やミスを大幅に削減可能です。

最大の強みは、同シリーズの給与計算や経費精算、請求書管理などのバックオフィス機能とデータがシームレスに繋がる点にあります。

これにより、二重入力を防ぎながら経営状況をリアルタイムに可視化でき、損益分岐点のシミュレーションなど高度な分析に基づいた迅速な経営判断が可能となります。法改正への自動対応も迅速で、正確な帳簿付けと業務の生産性向上を両立したい企業に最適です。

弥生会計 Next

料金プラン	月額　2,900円～ 年額　34,800円～
トライアル期間	3ヵ月
導入実績	・株式会社Bridal Plus ・株式会社自由が丘フラワーズ ・株式会社 セイエンタプライズ ・フリーランスのカメラマンなど
製品タイプ	クラウド型・インストール型
公式サイト	https://www.yayoi-kk.co.jp/

弥生会計 Nextは、長年中小企業に愛されてきた「弥生会計」の信頼性と最新のクラウド技術を融合させた会計ソフトです。

最大の強みは、初心者でも迷わず使いこなせる圧倒的な操作性と、業界最大規模のカスタマーセンターによる手厚いサポート体制にあります。

導入により、銀行口座やクレジットカードの取引データを自動で取得・連携できるようになり、手入力による転記作業や仕訳のミスを大幅に削減して経理業務を効率化できます。

また、蓄積されたデータはグラフィカルなレポートとして自動集計されるため、経営状況の可視化も容易です。法改正への対応も迅速で、クラウド型ならではの自動アップデートにより常に最新の状態で運用可能です。

多くの税理士事務所が推奨しているソフトでもあるため、外部との連携もスムーズに行え、安定した経営基盤の構築を強力に支援します。

PCAクラウド会計

料金プラン	月額13,860円〜
トライアル期間	2ヶ月
導入実績	製薬会社、印刷会社、飲食業、建設業など
製品タイプ	クラウド
公式サイト	https://pca.jp/area_product/cloud/prokai_cloud_top.html

PCAクラウド会計は、老舗メーカーならではの高い信頼と専門的な管理機能を兼ね備えた、成長中の中小企業に最適なソフトです。導入により、仕訳の承認ワークフローや部門別の階層管理など、内部統制を意識した高度な経理業務をクラウド上で実現できます。

他社にない強みは、同シリーズの給与計算や販売管理とのシームレスな連携に加え、外部APIを通じて多彩なサービスと繋がる柔軟性です。

また、銀行取引の自動取得やAIによる自動仕訳機能により、手入力作業を大幅に効率化し、経営データをリアルタイムに可視化できます。

法改正への迅速な自動対応や、24時間監視の堅牢なセキュリティ体制も備えており、将来的な事業拡大を見据えて基幹システムを整えたい企業に選ばれています。

勘定奉行クラウド

小規模企業向けプラン	iEシステム：年額93,000円 iJシステム：年額141,000円、初期設定50,000円
中小企業向けプラン	iAシステム：年額234,000円、初期設定50,000円 iBシステム：年額282,000円、初期設定60,000円 iSシステム：年額336,000円、初期設定70,000円
トライアル期間	30日間
導入実績	三菱地所、sansan、TOTO、BSフジなど
製品タイプ	クラウド
公式サイト	https://www.obc.co.jp/bugyo-cloud/kanjo

※その他、中堅企業、グループ企業、グローバル企業向けのプランがある

勘定奉行クラウドは、長年の実績に裏打ちされた高い信頼性と、圧倒的な入力スピードが強みの中小企業向け会計ソフトです。

導入により、国内ほぼ全ての金融機関から取引データを自動で取得・連携できるだけでなく、AIが過去の仕訳を学習して自動起票を行うため、手入力作業を最大9割削減し、経理業務を劇的に効率化します。

他社にない強みは、プロの経理担当者が求める操作性をクラウドで再現している点です。キーボードのみで完結する高速入力や、独自の経理ルールに沿った自動チェック機能により、作業ミスを未然に防ぎながら月次決算を迅速化できます。

また、50種類以上の豊富な帳票データにより、多角的な経営分析をリアルタイムで行える点も魅力です。法改正への自動対応はもちろん、税理士とのデータ共有もスムーズに行えるため、企業の成長に合わせた強固な会計基盤を構築したい中小企業に最適です。

中小企業向け会計ソフトを導入する際の注意点

中小企業向けの会計ソフトを導入する上での注意点を紹介します。

初期設定・導入時にかかる手間

中小企業の会計ソフト導入において、最も注意すべき点は初期設定という地盤固めに相応の工数がかかることです。

クラウド型ソフトは導入後の効率化が魅力ですが、稼働前には自社に合わせた勘定科目の整理や期首残高の登録、銀行口座・クレジットカードとのAPI連携設定といった細かな作業が不可欠です。

これらの設定を曖昧なまま進めると、自動取得した取引データが正しく分類されず、かえって修正作業に追われることになりかねません。

また、導入初年度は過去の会計データ移行や、新しい操作方法への慣れも必要なため、経理業務が一時的に増大する傾向にあります。

初期設定をスムーズに完了させ、経営判断に直結する正確なデータ管理体制を築くためには、導入支援サービスや専門家への相談も視野に入れ、余裕を持ったスケジュールで対応することが成功への近道となります。

社内に最低限必要な会計知識

中小企業の経理業務を劇的に効率化するクラウド型会計ソフトですが、導入すれば全ての作業が自動で完結し、知識が不要になるわけではありません。

ソフトが銀行取引などのデータを自動で取得・連携しても、その内容がどの勘定科目に該当するのか、最終的な確認作業を行うには最低限の会計知識が不可欠です。

特に、複雑な取引や例外的な経理処理が発生した際、ソフトが推論したデータが経営実態に即しているかを正しく判断できなければ、誤った会計データが蓄積され、経営状況の把握を妨げるリスクがあります。

導入により単純な入力作業は削減されますが、インボイス制度などの法改正への適切な対応や、自社の数字を正しく読み解くための基礎知識は依然として重要です。

ツールに頼り切るのではなく、ソフトの機能を最大限に活用して経営基盤を強固にするためにも、社内の担当者が一定の会計・簿記の基本を理解しておくことが、スムーズな運用と確実な効率化を実現する鍵となります。

既存システム・業務フローの相性

中小企業の会計ソフト導入において、既存のシステムや現場の業務フローとの相性を確認することは、経理業務の効率化を左右する極めて重要な工程です。

優れたクラウド型ソフトを導入しても、現在利用している販売管理や給与計算システム等とのデータ連携がスムーズにいかないと、結局は手作業による転記やCSV出力による読み込み作業が発生し、導入メリットが半減してしまいます。

また、自社独自の承認ルートや現場での取引管理ルールがソフトの仕様と乖離している場合、既存の業務フローを無理に変更することで現場に混乱を招き、経営情報の反映が遅れるリスクもあります。

導入前には必ず、自動で取得できるデータの範囲や外部連携の可否を精査し、自社の経理実務の流れに柔軟に対応できる機能を備えているかを確認しましょう。

税理士との連携可否

中小企業の経理業務を円滑に進めるためには、導入する会計ソフトと顧問税理士との連携可否を事前に確認することが極めて重要です。

クラウド型ソフトの多くは、税理士に専用のアカウントを付与することで、リアルタイムに会計データを共有できる機能を備えています。

しかし、事務所によっては特定のソフト以外には対応していないケースもあり、確認不足のまま導入すると、データの受け渡しや決算作業で余計な手間が発生し、効率化のメリットが損なわれる恐れがあります。

自動で取得した取引内容の確認や法改正への対応について、ソフトを通じてスムーズな助言を受けられる体制を整えることは、経営の安定に直結します。

自社の作業負担を軽減するだけでなく、専門家との連携を強化して経営データを正しく活用するためにも、導入前に必ず相談することをお勧めします。

中小企業向け会計ソフトに関するよくある質問

まとめ

中小企業向けの会計ソフトおすすめや、機能、導入メリットなどを紹介してきました。

中小企業向けの会計ソフトを比較・検討する際は以下の点に注目しましょう。

上記を踏まえた上で、当記事でおすすめする中小企業向けの会計ソフトは以下の通りです。